应用Reak-time PCR对基因芯片结果的验证分析(1)
【摘要】目的:应用real-time PCR方法对基因表达谱芯片分析结果进行验证,并提高芯片结果的可信度。方法:从NOR1基因转染HepG2细胞前后的芯片分析差异基因中选择p15和MAGE A6基因,用real-time PCR检测其在转染前后HepG2细胞中的相对含量,与芯片分析结果进行比较。结果:real-time PCR对p15、MAGEA6检测,实验组的表达量分别为对照组的 2.692倍和2.535倍(芯片检测结果分别为2.989和2.118倍),与芯片检测结果具有相同的方向性,且数据非常接近。结论:cDNA基因芯片和real-time PCR分析基因表达变化均可信,基因芯片筛选基因表达谱具有高通量大规模的特点,而real-time PCR则适合单个基因表达变化的研究 ,两者互为补充和印证。
【关键词】实时荧光定量PCR;基因芯片;P15;NOR1基因
文章编号:1009-5519(2007)21-3187-03 中图分类号:R446 文献标识码:A
如果希望筛选特定肿瘤发生、发展和转移等病理过程牵涉的所有基因表达,基因芯片是目前最有效的工具。我们用人17K基因表达芯片对pcDNA3.1(+)质粒转染和pcDNA3.1(+)/NOR1转染后HepG2细胞进行基因表达差异分析。研究结果发现,芯片中共有2倍表达差异的基因/EST 共162条,其中103条表达下调,59条表达上调 ......
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