岳阳汉族人群HLA-C高分辨等位基因多态性分析
1资料与方法,2结果,3讨论
孙 昂,粟玉萍,代 敏,苏湘晖,胡 滨,陈 敏(岳阳市中心血站,湖南414000)岳阳汉族人群HLA-C高分辨等位基因多态性分析
孙昂,粟玉萍,代敏,苏湘晖,胡滨,陈敏(岳阳市中心血站,湖南414000)
目的了解岳阳汉族人群人类白细胞抗原-C(HLA-C)高分辨等位基因多态性及分布特征。方法2014年10月至2015年8月采用基于Illumina Miseq二代测序技术对岳阳地区2 504例造血干细胞捐献志愿者HLA-C进行高分辨基因分型,直接计算等位基因频率,对其分布规律进行统计学分析。结果2 504例造血干细胞捐献志愿者中检出67个HLA-C等位基因,其中频率大于0.050 0的常见等位基因分别为C*03:03:01、C*03:02:02:01、C*08:01:01、C*03:04:01:02、C*07:02:01:01、C*01:02:01。HLA-C位点基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡,观察值(0.880 2)与期望值(0.876 6)比较,差异无统计学意义(P=0.214 5)。结论获得了岳阳地区汉族人群HLA-C等位基因的分布规律和特征,为人类学、移植配型、疾病相关性等研究提供了参考数据。
HLA-C抗原/遗传学;等位基因;基因频率;多态性,单核苷酸;高分辨基因分型
人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因系统根据编码分子的分布与功能不同分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ3大类,HLA-C属Ⅰ类基因。HLA-A、HLA-B、DRB1基因是早期研究的与造血干细胞移植密切相关的3个功能基因,随着非血缘造血干细胞移植的增加,HLA-C基因在造血干细胞移植中的重要性日益受到重视[1]。目前,国外造血干细胞移植均对供患者进行HLA-C高分辨基因配型。本研究采用高分辨分型技术对岳阳地区2 504例汉族造血干细胞捐献者的血液标本进行HLA-C基因分型,旨在从高分辨水平了解HLA-C基因多态性及分布特征 ......
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