毛干检材STR基因分型成功率的影响因素研究
根毛,基因座,黑色素,1材料与方法,2结果,3讨论
郑阳阳,郑文彦,吴伟斌,杜蔚安(广东华美众源生物科技有限公司,广东 佛山 528000)
自然脱落毛发是法医常见物证检材之一,在案件侦破中具有重要线索与证据价值[1]。带毛囊毛发的短串联重复序列(STR)分型技术成熟、可靠,已广泛用于个体识别、亲缘关系鉴定等[2-3]。而在案发现场采集到的毛发样本70%是处于休眠期的脱落毛发,毛囊退化或只剩下毛干,DNA分型难度较大,目前,常用办法是测序分析线粒体DNA高度变异D-环区[4]。虽然线粒体DNA含量比核DNA丰富,检出率更高[5-6],但存在母系遗传、异质性、分析数据无法进入数据库检索比对等缺点[7-8],导致其应用范围和案件线索作用有限。本研究从毛干DNA含量、DNA降解程度、黑色素抑制3个方面入手,设计实验分析和验证了无毛囊毛干检材在STR分型过程存在的难点,并初步研究了解决策略,以提高无毛囊毛干的分型成功率。
1 材料与方法
1.1材料
1.1.1样本采集 2019年10月收集15名健康志愿者毛干样本,均为健康志愿者自然脱落毛发(未经染烫等化学处理);用木梳轻轻梳理头皮,收集存留在梳子上的毛发,肉眼观察毛根部位体积较小、呈干瘪坚硬状,显微镜下观察毛球萎缩、无根鞘附着。单根毛干实验时尽量选择长度为20 cm的毛发,若单根长度小于20 cm可选择多根混合使用,计算叠加长度。采集健康志愿者口腔唾液样本作为对照样本(毛干样本与唾液对照样本分型结果一致的基因座计为成功分型基因座)。标准对照采用人类基因组DNA 9947A。
1.1.2主要试剂与仪器 Qubit-iT dsDNA HS Assay试剂盒(ABI,美国)、AGCU Expressmarker 16CS STR分型试剂盒(无锡中德美联,中国)、黑色素标准品(Sigma-aldrich,美国)、Qubit荧光定量系统(ABI,美国)、Mastercycler?nexus聚合酶链反应(PCR)仪(Eppendorf,德国)、3130XL型遗传分析仪(ABI,美国)、GeneMapper ID-X数据分析软件(ABI,美国)等 ......
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