1株高产生物膜发酵乳杆菌抗胁迫特性与全基因组分析
胆盐,活菌,1材料与方法,1材料与试剂,2试验方法,2结果与分析,1发酵乳杆菌733生长量与生物膜形成量,2发酵乳杆菌733对模拟人工胃肠液耐受性及有害代谢产物试验结果,3发酵乳杆菌733抗逆性试验结果,4发酵
张悦,蒋 柠,郑砚学,顾 悦,王 艳,贺银凤*(1 内蒙古农业大学食品科学与工程学院 呼和浩特010018 2 内蒙古自治区质量和标准化研究院 呼和浩特 010070)
发酵乳杆菌(Lactobacillus fermentum)是一种主要定植于动物肠道中的异型发酵乳酸菌[1],能调节天然免疫与适应性免疫[2],具有抗炎症和降胆固醇等作用[3]。研究发现,发酵乳杆菌不仅可以在发酵驼乳时产生天然新型抗氧化肽[4],在发酵过程中,还可以代替发酵香肠中亚硝酸盐,降低亚硝酸盐在香肠中的残留风险。此外,该菌株通过防止脂肪氧化、蛋白质分解、肌红蛋白氧化和提高游离氨基酸含量,有效提高香肠的品质和营养价值[5]。然而,发酵乳杆菌在人类的肠道[6]或者在用于食物发酵时经常受到不同的胁迫[7],因此,增强其抗逆性变得非常关键。
基因组学时代彻底改变了人们对所有生物基因的理解。这个时代起源于1995 年,Craig Venter和他的同事发表第1 个活的有机体的完整基因组序列——革兰氏阴性细菌流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae)。当时的基因组序列计划,包括人类基因组计划,都是利用定向测序的方法,即以有序的方式对基因组的已绘制区域进行单独测序。Venter 等研究表明,一种鸟枪式测序方法,即构建整个随机剪切的基因组鸟枪库,并使用序列支架组装它们的序列,可以更快地完成这一任务,并改变基因组序列计划的方向[8]。目前在NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/?term=Lactobacillaceae)数据库中上传的乳酸杆菌(Lactobacillaceae)全基因组共有5 726 组,其中植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)有792 组,德氏乳杆菌(Lactobacillus delbrueckii)有419 组,罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)有328 组,鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus)有230 组,而发酵乳杆菌只有107 组。对发酵乳杆菌全基因组的测定远少于其它乳酸杆菌,这不利于其优异特性及相关作用机制的研究。本文研究1 株高产生物膜发酵乳杆菌的益生和抗逆特性,采用全基因组测序技术分析该菌株的抗性机理,为后续提高其应对不良环境能力的研究提供参考。
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
1.1.1 菌株 试验菌株为前期分离筛选的1 株高产生物膜发酵乳杆菌733(Lactobacillus fermentum 733) ......
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