张悦，蒋 柠，郑砚学，顾 悦，王 艳，贺银凤*

    (1 内蒙古农业大学食品科学与工程学院 呼和浩特010018 2 内蒙古自治区质量和标准化研究院 呼和浩特 010070)

    发酵乳杆菌(Lactobacillus fermentum)是一种主要定植于动物肠道中的异型发酵乳酸菌[1]，能调节天然免疫与适应性免疫[2]，具有抗炎症和降胆固醇等作用[3]。研究发现，发酵乳杆菌不仅可以在发酵驼乳时产生天然新型抗氧化肽[4]，在发酵过程中，还可以代替发酵香肠中亚硝酸盐，降低亚硝酸盐在香肠中的残留风险。此外，该菌株通过防止脂肪氧化、蛋白质分解、肌红蛋白氧化和提高游离氨基酸含量，有效提高香肠的品质和营养价值[5]。然而，发酵乳杆菌在人类的肠道[6]或者在用于食物发酵时经常受到不同的胁迫[7]，因此，增强其抗逆性变得非常关键。

    基因组学时代彻底改变了人们对所有生物基因的理解。这个时代起源于1995 年，Craig Venter和他的同事发表第1 个活的有机体的完整基因组序列——革兰氏阴性细菌流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae)。当时的基因组序列计划，包括人类基因组计划，都是利用定向测序的方法，即以有序的方式对基因组的已绘制区域进行单独测序。Venter 等研究表明，一种鸟枪式测序方法，即构建整个随机剪切的基因组鸟枪库，并使用序列支架组装它们的序列，可以更快地完成这一任务，并改变基因组序列计划的方向[8]。目前在NCBI(https：//www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/?term=Lactobacillaceae)数据库中上传的乳酸杆菌(Lactobacillaceae)全基因组共有5 726 组，其中植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)有792 组，德氏乳杆菌(Lactobacillus delbrueckii)有419 组，罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)有328 组，鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus)有230 组，而发酵乳杆菌只有107 组。对发酵乳杆菌全基因组的测定远少于其它乳酸杆菌，这不利于其优异特性及相关作用机制的研究。本文研究1 株高产生物膜发酵乳杆菌的益生和抗逆特性，采用全基因组测序技术分析该菌株的抗性机理，为后续提高其应对不良环境能力的研究提供参考。

    1 材料与方法

    1.1 材料与试剂

    1.1.1 菌株 试验菌株为前期分离筛选的1 株高产生物膜发酵乳杆菌733(Lactobacillus fermentum 733) ......