【摘 要】计算机辅助药物设计是在计算机技术发展之后，分子生物学、遗传学、信息学、计算机化学等多学科交叉结合后产生的新学科，对现代临床药物筛选与研发具有重要意义。也是现阶段药物设计的重要工具，对临床医疗卫生事业的发展具有重要意义。本文从计算机辅助药物设计概念出现，对计算机辅助药物设计在药物研发中的应用进行浅析。

    【关键词】计算机辅助药物设计;药物研发;药物设计

    1 计算机辅助药物设计概念

    计算机辅助药物设计是现代药物研发的重要手段，以计算机辅助药物设计兴起的一个新学科就是合理药物设计。合理药物设计是一种相对概念，其指的是更有针对性、更有效率地进行药物设计与研发。简单来说，合理药物设计就是遵循一定的规律，从遗传学、分子生物学、计算机化学等多个方面合理分析一种分子的化学活性后对其生物活性、亲和性、药效进行综合分析后设计成药物。相较于传统药物设计而言，计算机辅助药物设计的模式与体系更加完善，是药物研发定性、定量、定向后的结果。

    计算机辅助药物设计(简称CADD)，是利用计算机化学的基本原理，通过模拟药物在机体内的作用和代谢后分析分子的化学活性后设计出新的药物模型进而实现药物合理开发与设计。虽然CADD出现的时间较短，但自最初构效关系提出到现在计算机辅助药物药物设计也已经经过了40年的历程，在这个过程中也取得了不小的成效，如Indinavir(HIV蛋白酶抑制剂)、唾液酸酶抑制剂、donepezil(老年痴呆症药物)都是计算机辅助药物设计的成果。

    2 计算机辅助药物设计的理论基础

    CADD是基于分子模拟技术和数理统计方法实现的一种合理药物设计，其融汇了分子力学方法、量子力学方法、蒙特卡罗及分子动力学方法、数值最优化技术等诸多方法 ......