基于基因进化树和地理数据库追踪禽流感病毒变异(2)
【Key words】Avian flu; Gene Mutation;Google earth;Geographic Visualization;Gene Evolutionary Tree;Ka/Ks;Jukes-Cantor Algorithm; China流行性感冒(influenza流感)是由流感病毒引起的急性呼吸道传染病。该病病毒易发生抗原性变异,加之人群对变异株普遍易感,常迅速导致世界性的流感大流行[1- 2]。在流感病毒的发病过程中,禽流感(avian flu)由于其在世界各国此起彼伏的暴发和流行,及可能与人流感病毒进行基因重组,成为研究的热点。虽然迄今并没有高致病性禽流感病毒能在人与人之间直接传播的确切证据,但是由于两种病毒的基因相似性使得人们担心这种可能性正在逐渐增大。 流感病毒基因组主要由8个RNA片段组成。这8个片段为:聚合酶B2(polymerase B2, PB2)、聚合酶B1(polymerase B1)、聚合酶A(PA)、血凝素A(HA)、神经氨酸酶(neuraminidase, NA)核蛋白(nucleoprotein, NP)、基质(M1)以及非结构蛋白(non-structural, NS1)[3-5] ......
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