【摘要】目的 应用系统生物学方法，研发一种基于转录组表达谱的基因网络可视化工具，以直观显示急性心肌梗死后早期的转录组和代谢调控的整体变化。方法 在美国国立卫生研究中心(NCBI)GEO数据库下载编号为GDS2331的一个急性心肌梗死后大鼠心脏左心室的基因芯片表达文件，其平台编号为GPL83。筛选实验时间在15 min，60 min，4 h，12 h，24和48 h的假手术和急性心肌梗死模型亚组数据，利用Mathwork bioinformatics toolbox工具包将数据转化为计算机可读的结构体。利用模式识别算法剔除表达背景噪声；最后获得心肌梗死建模后表达模式扰动最明显的基因谱。利用K-mean算法对这些基因进行分类，并进行基因本体分析(gene ontology， GO)。进而将有关通路标定在京都基因和基因组百科数据库(kyoto encyclopedia of genes and genomes， KEGG)中，形成基因组-表达谱系统分析。结果 共有1400个基因被筛选出来。在损伤后的前48 h，这些基因的变化模式可归为16类。根据可以获得基因本体分析发现：在生物学过程上，心肌梗死后早期调控发生改变主要和发育基因相关，其中主要包括蛋白激酶B信号传导途径，中枢神经系统发育途径，以及cytochalasin B调控相关途径 ......