市卫生局(包括县卫生局)主要负责以下几个方面的工作：成立居民健康卡服务中心，明确市、县合管办协助卫生信息中心做好居民健康卡管理服务工作；明确各级卫生单位所负责的居民健康卡申领受理和发放任务；试点期间利用市级区域卫生信息平台综合业务管理系统，在全市四个系统部门(全市卫生系统、市农行系统、市建行系统和市电信系统)进行发卡信息采集；建立全市居民健康卡发卡信息库，将采集信息上报省卫生厅，并与省公安厅身份证数据库进行比对；选定市农行、市建行为全市居民健康卡合作建设单位，组织市辖区和各县分别与合作银行签订建设合作协议；在省卫生厅与省农行、建行指导下分别确定市内两所三级医院分别承担两家银行发行的居民健康卡在医院的应用试点工作；统一全市居民健康卡的业务应用，包括应用范围、应用流程、配套服务等方面；承担省卫生厅居民建卡跨市使用等。

    省公安厅协助省卫生厅将居民健康卡基本信息与公安身份证数据库对接，对居民健康卡基础信息进行比对，验证居民健康卡基本信息准确性和获取发卡对象照片信息。

    省合作银行主要负责与省卫生厅共同确定居民健康卡密钥、芯片、COS、读卡器等相关生产、服务供应商之间的沟通；支持地方银行(农行、建行)与市县卫生局签订居民健康卡合作共建协议；支持地方银行(农行、建行)与市县卫生局进行居民健康卡业务合作 ......