直接发生联系，较符合条件反射的特征。可以发现在皮层与皮层下两条通路中，杏仁核都伴演着重要角色。虽然现有研究发现前额叶会对杏仁核的情绪加工进行调控。例如，Stalnaker等人的动物研究发现，眶额皮质的损伤会削弱情绪事件的倒序学习能力，而如果同时损伤杏仁核的基底外侧核则不会出现这种学习的缺陷，但不可否认杏仁核在情绪加工中的枢纽地位。

    在恐惧条件反射建立的过程中，杏仁核中的外侧核(LA)、基底核(B)、附属基底核(AB)以及中央核(CE)是最为相关的区域。从当前主流的模型看来，LA是信息传递中转站，接受来自丘脑、海马和皮质的信息，然后根据这些信息的不同性质来激活不同靶区。LA具有高度的可塑性，带有多种类型的细胞受体，如GABA(γ氨基丁酸)受体、阿片受体、糖皮质激素受体和M型乙酰胆碱受体等，因此LA是记忆中发生长时程增强效应(long-term potentiation，LTP)的主要区域。当条件刺激传入时，LA突触后细胞电压门控通道打开，钙离子流入，引起胞内级联反应，诱导基因转录，导致蛋白质的合成。实验证明向LA注射蛋白质合成抑致剂会干扰条件反射的建立。传统观点认为CE是LA的靶点，经LA处理的信息被投射到CE，再由CE传送给下游脑区。但是也有新观点认为CE并不只是被动地接受外侧核的投射，其本身也具有可塑性，可以直接接受并处理来自感觉区的信息：而且LA与CE之间的联系并不是直接的 ......