采用人基因表达谱芯片筛选肺癌转移相关基因的初步研究(1)
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【摘要】 目的 应用基因芯片技术分析人高、低转移肺巨细胞癌细胞株的基因差异表达谱，筛选与肺癌转移相关基因。方法 提取人高转移肺巨细胞株95D和人低转移肺巨细胞株95C的mRNA，通过逆转录，制备分别用cy5—dUTP和cy3—dUTP进行标记的cDNA探针，并与芯片杂交。经过Scan Array 3000扫描仪扫描，获取图象及对杂交信号进行数据分析，筛选出95D和95C细胞表达差异的基因谱,并对其中部分基因进行RT—PCR分析、验证。
结果 在所检测95C和95D细胞中，466条基因有表达差异，其中具有同一Genebank量的有108对，上调基因47对，下调基因61对。对其中KIAA1108、PGR1、JWA、S182、Jab1 部分差异表达基因，经RT—PCR 技术验证，结果与基因芯片基本符合。结论 肺癌转移过程与多种基因作用有关，基因芯片技术可为肺癌转移相关基因的筛选，提供有效方法。
【关键词】 肺肿瘤; 基因筛选;肿瘤转移；逆转录—聚合酶链反应
肺癌仍然被认为是工业化国家癌症相关死亡的主要原因，尽管癌症的诊断和治疗不断发展，但目前的5年生存率14%仅稍高于60年代的8%[1]，预防和早期诊断无疑很重要。因此，肿瘤发生和转移的靶点成为目前研究的焦点。肿瘤的浸润和转移是决定肿瘤病人预后的一个关键因素。肿瘤的转移是一系列肿瘤—宿主相互作用一系列复杂过程的结果[2]。利用基因芯片从分子水平探索肺癌转移相关基因，对防治肺癌的转移具有积极的指导意义。
1 材料和方法
1.1 细胞株
所用的细胞株为人肺巨细胞癌细胞株95D及95C[3,4](由解放军总医院病理科陈乐真教授惠赠)，系源于人肺巨细胞癌母系细胞(PLA—801)中分出并建成的亚系。两者为共源细胞株，具有相同的遗传背景。其中95D细胞株具有自发性高转移生物学特性，而95C细胞株具有不转移(或低转移)生物学特性。
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