郑州市B19病毒分离株全基因的克隆及序列测定
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关键词 D19;聚合酶链反应;序列分析
中图分类号 R373
摘要 目的:克隆和测定在郑州市得到的B19病毒分离株全基因序列。方法:采用聚合酶链反应(PCR)技术从1例B19阳性的流产患者血清中分段扩增B19病毒全基因,获得?个互相重叠的片段,分别长814bp(1—814),849 bV(753—1 601),663 bp(1 523~1 185),738 bp(2 124~2 861),1 011 bp(2 790—3 800),1 014 bp(3 747~4 760),914 bP(4 681~5 594)。将其分别克隆入T载体,进行测序分析。结果:郑州市B19病毒分离株全基因长5 594个核苷酸,有3个开放读码框架(ORF)。第1个ORF位于615—2 630位核苷酸,编码672个氨基酸,第2个ORF位于2 623—4 968位核补酸,编码782个氨基酸,第3个ORF位于3 304~4 968位核苷酸,编码555个氨基酸。在该基因中4种碱基在基因组中所占比例为:A,19.58%(1 655/5 594),T,26.52%(1 484/5 594),C,22,88%(1 280/5 594),C,21.02%(1 175/5 594):郑州B19病毒分离株基因序列与GenBank中NC_000883高度同源;存在10个碱基改变,只有1个引起氨基酸改变(3 752位C→G导致Set→Cys); 结论:郑州B19病毒分离株和NC_00883属同一基因型,
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