DNA甲基化与肿瘤(2)
(1)甲基化特异性PCR(MS—PCR)：通常在亚硫酸氢钠处理后，分别针对目的片段完全甲基化的情况和完全非甲基化的情况设计引物。这样样本DNA即可根据自身的甲基化状态分别在相应的PCR组中进行扩增，并将结果通过凝胶电泳图像显示出来。根据扩增条带所在的PCR组可判断样本中甲基化的状况。MS—PCR的特异性很高，操作简便，费用和耗时都较小，但只能部分检测DNA甲基化的状态。对MS—PCR进行适当改进后，设计出半巢式PCR 和巢式PCR ；而改进的实时MS—PCR 可对产物进行定量分析。这些方法都可提高MS—PCR的灵敏性。(2)亚硫酸氢钠法依赖的基因测序法(BSP bisulfite sequence-PCR)：是一种对DNA样本进行亚硫酸氢钠处理和PCR扩增克隆及DNA测序结合的检测方法。然后，根据核苷酸序列中C—T转化情况可判断样本中的甲基化状态，如与原序列比较，发生了C—T的转变，则表示该处未发生甲基化，如没有C—T转变，则发生甲基化。此方法通过测序可获得样本DNA序列中较全面的甲基化信息。
以上两种方法大体过程有很多相似之处，但在引物的设计上有较大差别，BSP引物不包括CpG位点 ......
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