肾透明细胞癌进展枢纽基因的WGCNA筛选(2)
尽管癌症的检测和治疗取得了很大进展,但ccRCC的总生存率仍然很低。超过1/3的病人在诊断时已经发生转移,Ⅳ期ccRCC的5年标准化相对生存率仅为6%,而Ⅰ期约为84%[3-4]。因此,研究ccRCC的发生发展机制,寻找新的生物标志物对ccRCC的早期诊断、治疗及预后判断具有重要意义。传统的“单疾病单基因”的研究模式不能从多基因协同角度了解疾病的发生与发展。本研究采用生物信息学的方法,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA),将功能相似的基因归入同一基因模块,探究基因之间的相关性以及基因模块和临床特征之间的关联,筛选枢纽基因,以了解ccRCC发生进展过程中的关键基因及信号通路,为ccRCC治疗寻找新的靶点。1材料与方法
1.1差异表达基因的筛选
从NCBI的GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)下载编号GSE73731的ccRCC芯片数据集。该数据集基于GLP570平台,包括265例ccRCC组织 ......
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