肾透明细胞癌进展枢纽基因的WGCNA筛选(3)
2.5GO和KEGG富集分析为了了解枢纽模块的可能功能,对green模块中的基因进行了GO和KEGG富集分析。GO富集分析显示,模块基因主要富集在细胞周期、细胞器分裂、核分裂等生物学过程;KEGG富集分析显示,模块基因主要富集在细胞周期通路上。见图6。
3讨论
本研究利用生物信息学方法,通过对ccRCC芯片数据集GSE73731进行分析,筛选得到表达上调基因152个,表达下调基因181个。通过WGCNA,将表达模式相似的基因进行聚类,并分析模块与特定性状或表型之间关联。结果显示,green模块与ccRCC病理分级的相关性最高,green模块内基因集与肿瘤的进展与预后密切相关。为进一步筛选在ccRCC进展过程中的关键基因,将green模块中进一步筛选出的基因与蛋白相互作用网络筛选出的基因交集,筛选出CEP55、CCNB1、NUF2、BUB1B、KIF14共5个枢纽基因。对GSE73731数据集进行线性回归分析,结果显示各枢纽基因与ccRCC组织学分级密切相关,且BUB1B基因具有较高的诊断价值 ......
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