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编号:13541062
肾透明细胞癌进展枢纽基因的WGCNA筛选(1)
http://www.100md.com 2019年8月1日 《青岛大学学报(医学版)》 20194
肾透明细胞癌进展枢纽基因的WGCNA筛选,肾细胞,寡核苷酸序列分析,数据挖掘
     [摘要]目的 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别肾透明细胞癌发生及进展过程中的枢纽基因。方法从基因表达综合数据库下载GSE73731数据,通过WGCNA筛选枢纽基因,分析枢纽基因的表达水平及其与肿瘤分级、分期、预后的关系,使用GEPIA数据库和UALCAN数据库进行验证,并对枢纽模块基因进行GO和KEGG富集分析。结果通过构建共表达网络,确定green模块(包括355个基因)为枢纽模块,进一步筛选得到CEP55、CCNB1、NUF2、BUB1B、KIF14共5个枢纽基因。各枢纽基因与肾透明细胞癌组织学分级密切相关(t=17.53~25.18,P<0.01),且BUB1B基因对低级别与高级别肾透明细胞癌具有较高的诊断价值(AUC=0.706,P<0.01) ......
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