EB病毒相关伯基特淋巴瘤差异基因表达分析(3)
利用DAVID在线软件对400个DEGs分类分析结果显示,上调基因主要参与调控生长因子活性通路(GO:0008083)[10]、调控肝素结合通路(GO:0008201)、细胞外间隙通路(GO:0005615)、片状伪足通路(GO:0030027)、钙介导的信号通路(GO:005084)、钾离子跨膜运输通路(GO:0071805)等,以上通路刺激肿瘤的发生。下调基因则主要参与伽马微管蛋白结合通路(GO:0043015)、poly(A)RNA结合通路(GO:0044822)、蛋白酶体调节粒子通路(GO:0008541)、内质网膜通路(GO:0005789)、逆行性小囊泡运输通路(GO:0006890)等。见图1B、C。2.3 PPI分析
在蛋白质间相互作用图中,颜色越亮、面积越大,说明与其他蛋白质关联度越大[11](图1D)。从中筛选10个关联度最大的蛋白,其全称、缩写、关联度见表2。
2.4 基因表达验证
实时荧光定量PCR结果显示,EBV阳性与阴性BL细胞系中ACACB、CTTN、IGF1表达差异无统计学意义(t=0.103~1.294,P>0.05),与网络数据不相符;CDH1、PRPF19、UBE2N表达差异有统计学意义(t=3.878~9.730,P<0.05),网络数据和实验数据相符合;F2、H6PD、VEGFA、YARS表达差异均有统计学意义 (t=7.055~32.601 ......
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