解整合素—金属蛋白酶33基因位点多态性与慢性阻塞性肺疾病的相关性研究(1)
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[摘要] 目的 探讨解整合素-金属蛋白酶33(ADAM33)基因BC+1及F+1位点多态性与山西地区汉族人群慢性阻塞性肺疾病(COPD) 的关系。 方法 采用聚合酶链式反应(PCR)、DNA测序及序列对比的方法对103例COPD患者(COPD组)和100例健康者(对照组)ADAM33基因的BC+1及F+1位点进行多态性分析。 结果 ADAM33基因BC+1位点3种基因型AA、AG、GG基因型频率在COPD组中分别为15.5%、45.6%和38.8%,在对照组中分别为17.0%、56.0%和27.0%,两组基因构成比比较,差异无统计学意义(χ2 = 3.296,P > 0.05),A和G等位基因型的频率在COPD组中分别为38.3%和61.7%,在对照组分别为45.0%和55.0%,两组比较差异无统计学意义(χ2 = 1.847,P > 0.05)。F+1位点3种基因型AA、AG、GG基因型频率在COPD组中分别为20.4%、38.8%和40.8%,在对照组中分别为7.0%、51.0%和42.0%,两组构成比比较差异有统计学意义(χ2 = 8.287,P < 0.05),A和G等位基因型的频率在COPD组中分别为39.8%和60.2%,在对照组分别为32.5%和67.5%,两组比较差异无统计学意义(χ2 = 2.345,P > 0.05)。BC+1位点未发现有增加患COPD的风险(OR = 0.760,P > 0.05),但F+1位点可能有增加患COPD的风险(OR = 1.357,P < 0.05)。 结论 ADAM33基因F+1位点多态性对山西地区汉族人群COPD发病有一定相关性;但BC+1位点多态性对该人群COPD发病的影响不明显。
[关键词] 慢性阻塞性肺疾病;基因多态性;单核苷酸
[中图分类号] R563.05 [文献标识码] A [文章编号] 1673-7210(2013)01(c)-0015-03
慢性阻塞性肺疾病(COPD)是一组以气流受限为特征的可以预防和治疗的肺部疾病[1]。COPD主要累及肺部,但是也能引起肺外的不良效应,目前仍不完全清楚其发病机制。有关研究表明遗传因素与COPD的发生较为密切,某些相关的易感基因与各种环境因素相互作用,从而导致COPD的发生。解整合素-金属蛋白酶(a disintegrin and metalloprotease,ADAM)33(ADAM33)基因位于第20号染色体短臂13号位(20p13)[2],是ADAM基因家族中的成员。Van Eerdewegh等[3]首次于2002年通过研究认为ADAM33基因与气道高反应有关联,并且是哮喘的一种易感基因。本研究以COPD患者和健康体检者为研究对象,对ADAM33基因BC+1及F+1位点多态性进行检测,旨在分析ADAM33基因BC+1及F+1位点多态性与COPD的相关性,进而从分子水平上探索遗传易感因素在山西地区汉族人群COPD发病中的作用。
1 资料与方法
1.1 一般资料
2011年6月~2012年3月在太原市中心医院呼吸科住院的汉族COPD患者103例,其中,男69例,女34例;年龄50~90岁,平均(70.8±5.9)岁;吸烟56例;所有COPD的诊断均符合中华医学会呼吸病分会制订的《慢性阻塞性肺疾病诊治指南(2007修订版)》[1]。对照组为同期健康查体者100例,其中,男57例,女43例;年龄50~90岁,平均(72.8±5.6)岁;吸烟57例。所有受试者均排除其他气流受限的疾病,如哮喘、支气管扩张症、肺结核纤维化病变、肺囊性纤维化、弥漫性泛细支气管炎以及闭塞性细支气管炎等,以及肺癌、肺部手术、肺间质纤维化和心脏病等病史,并对其进行胸部X线检查和肺功能测定。两组受试者均符合知情同意原则。两组性别、年龄、吸烟者比例比较差异无统计学意义(P > 0.05),具有可比性。
1.2 方法
1.2.1 DNA的提取 用含有乙二胺四乙酸二钠盐(EDTA-Na2)的抗凝管采集空腹静脉血3 mL,充分混匀,采用北京索莱宝科技有限公司的全血基因组DNA提取试剂盒,提取全血基因组DNA。
1.2.2 SNP位点引物的设计与合成 根据NCBI中提供的基因组序列自行设计一对引物,引物由上海生工生物技术有限公司合成。BC+1位点,上游:5'-TGAGCTTTGAGATTGCCCTC-3',下游:5'-TTACTCTTGCCCTCCTGGTAC-3';F+1位点,上游:5'-TGCCAGCTATTATCTGCGTC-3',下游:5'-CTGCCACAATGTACAGTTCC-3' ......
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