应用DiscoveryStudio软件预测烟酸姜黄素酯抗动脉粥样硬化的作用靶点(1)
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[摘要] 目的 运用计算机虚拟筛选技术预测烟酸姜黄素酯抗动脉粥样硬化作用的靶标蛋白。 方法 查阅与动脉粥样硬化相关靶标的文献，筛选出60余种与动脉粥样硬化相关的蛋白(分子对接的受体)，再对蛋白质晶体结构数据库PDB中的目标蛋白的三维结构活性部位进行分析，采用北京创腾科技有限公司的Discovery Studio分子模拟软件包(版本3.0)中的LibDock模块将烟酸姜黄素酯(配体)与受体蛋白进行分子对接。 结果 以对接得出的配体在受体结合位点处的结合形式(poses≥80)和对接吻合度参数(LibDockscore≥100)作为阈值，筛选出CRP、MMP13、ACAT、CETP等11种受体蛋白与烟酸姜黄素酯存在较强的相互作用。 结论 该研究结果可预测烟酸姜黄素酯抗动脉粥样硬化的可能作用靶点，对该药的抗动脉粥样硬化药效学研究有一定的指导意义。
[关键词] 烟酸姜黄素酯；标靶蛋白；分子对接
[中图分类号] R541.4 [文献标识码] A [文章编号] 1673-7210(2013)06(b)-0016-04
烟酸姜黄素酯是一种新型调脂抗炎的化合物，将具有强大升高高密度脂蛋白(HDL)功能的烟酸基团引入具有降脂兼抗炎抗免疫作用的姜黄素化合物中，使其发挥抗动脉粥样硬化(atherosclerosis，AS)的作用。既发挥姜黄素的抗炎、抗氧化、降血脂[1-7]的作用且避免其在体内的活性偏低、体内吸收少、代谢过快和生物利用度低等缺点[8-9]；又发挥烟酸增加HDL，改善相关内皮功能，降低总胆固醇和游离脂肪酸，减少血小板聚集，减轻促凝状态以及增加同型半胱氨酸的水平等[10-13]，且避免其单用存在促前列腺素合成、引起皮肤潮红、瘙痒、胃肠道刺激症状等副作用[14-15] ......
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