用于单核苷酸多态性数据聚类分析的方法比较(2)
在上式中,LCM的组合概率,用πijkABC表示,相应的,潜在类别概率,以πtX表示,其意义可以解释为:在观察变量处于局部独立的条件下,潜变量X在第t个水平的概率,即从样本中随机选取的观察对象属于潜在类别t的概率。容易证明,各个潜在类别的概率总和永远为100%即1,用公式表达为:
条件概率,用πitAX表示,其意义可以解释成:外显变量A的第i个水平更倾向于划归到第t个潜在类别的个体的概率。由于各个潜变量的各个水平处于相互独立的状态,所以各外显变量的条件概率总和为1,即:
1.2 参数估计与模型拟合
在潜在类别模型的参数估计过程中,最大似然法(maximum likelihood,ML)是被最广泛使用且计算软件中默认的方法。EM(expectation-maximization)、NR(Newton Rapson)算法在计算迭代过程中为最常用的方法,而其中前者更为常用。在潜在类别模型评价方面,AIC评分(akaike informationcriterion)和BIC评分(bayesian information criterion)成为使用最为广泛的拟合评价指标。两者共同点为:其计算理论基础都为似然比χ2检验 ......
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