ITS2序列分析在白花蛇舌草鉴定中的应用研究(2)
1.3 植物DNA提取、PCR扩增和测序将白花蛇舌草和3种混伪品的干燥植物分别用研钵碾成粉末,各取30 mg置离心管中,按照试剂盒说明书提取DNA。收集DNA溶液,-20℃冰箱保存。正向引物为ITS2F:5'-ATGCGATACTTGGTGTGAAT-3',反向引物为ITS3R:5'-GACGCTTCTCCAGACTACAAT-3'[19]。PCR反应体系包括25 μL 2×ES Taq Master Mix,2 μL正向引物ITS2F,2 μL反向引物ITS3R,9 μL超纯水,12 μL模板(基因组DNA),体系配制共为50 μL。使用PCR仪进行扩增,扩增程序:Step1:94℃变性5 min;Step2:94℃变性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸45 s(进行40个循环);Step3:72℃延伸10 min。PCR产物在0.7%的琼脂糖凝胶上电泳跑胶,获得单一条带后,将PCR产物送至华大基因貿易有限公司利用DNA分析仪进行双向测序。
1.4 数据处理
运用Codon Code Aligner 6.02(Condon Code Co. ......
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