手足口病是一种受多种肠道病毒引起的传染病，该传染病可引起患者手、足、口腔等部位产生皮疹和溃疡，并伴有发热等一系列并发症，多发生于5岁以下的婴幼儿[1-4]。手足口病以柯萨奇A16(CoxA16)和肠道病毒71型(EV71)为主要病原体[5-7]。两者引起的手足口病在临床症状方面较为相似，但EV71感染除了引起手足口病外，还能引起多种与神经系统相关的症状[8-10]。CoxA16型病原体先于EV71发现，至1969年美国首次确认EV71与手足口病有关后，EV71感染与CoxA16感染交替出现，蔓延至世界各地[11]。近年来，我国多个省份出现了儿童感染EV71病毒的状况，严重影响儿童的身体健康。但是，目前对引起手足口病的肠道病毒既无有效疫苗，又无特效预防药物本病的方法。

    目前，手足口病实验室检测主要采用病毒分离培养、血清学方法和普通RT-PCR方法。病毒分离培养和血清学方法无法及时对暴发疫情作出诊断，因其自身具有耗时长、技术要求高等限制因素；而普通RT-PCR方法虽然具有敏感、特异等优点，但步骤繁琐、耗时长、易交叉污染等，荧光定量RT-PCR技术是新兴针对病原体核酸的快速检测技术 ......