ImageJ在骨细胞陷窝特性3D呈现中的应用(2)
2 骨细胞陷窝特性的测量过程2.1 导入图像序列及图像属性设置
ImageJ软件可以支持TIFF、PNG、BMP、DICOM、GIP、JEPG等多种图片格式的输入。在三维重建之前,首先需要在ImageJ导入一组图像序列,使用File> Import> Image Sequence命令将100张连续的DICOM图像序列导入ImageJ。本文使用的图像序列为8周龄野生型雄性C57BL/6小鼠的胫骨骨干内侧皮质经过MicroXCT-200扫描得到的图像序列,扫描位置详见图1a。成功导入图像序列之后,根据扫描样本的实际大小设置ImageJ中的图像序列参数,以便后期进行骨细胞陷窝体积大小筛选使用。使用Image> Properties命令,设置图像序列的长度单位以及像素长度宽度等参数(图1b),例如本文使用的图像序列为100张连续的434.12 μm×445.61 μm大小的图像。
2.2 阈值分割及降噪处理
阈值分割是利用灰度直方图分析图像序列的灰度分布,从而实现将图像上的像素标记为背景或对象 ......
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