miRNA-494与慢性心力衰竭心肌纤维化相关性的生物信息学分析(2)
2 结果2.1 差异性miRNA
数据库检索并筛选出慢性心力衰竭与miRNA相关数据集GSE104150,其中包含人类健康对照及心力衰竭样本共16个,miRNA共2571个,将P值和logFC设定为:P < 0.01,logFC>2 or <-2,取前20个结果,绘制热图(图1,封四)。其中miRNA-494在慢性心力衰竭样本中呈高表达,见图2。经文献检索,miR-494在冠心病等心血管疾病中异常表达,并与慢性心力衰竭的发生发展相关。此外,miR-494在纤维化疾病中存在差异性表达,故选择miRNA-494作为进一步研究对象,探讨其在慢性心力衰竭心肌纤维化中的作用及影响。
2.2 miRNA-494靶基因预测
miRNA-494靶基因检索,TargetScan检索出2864条结果,miRWalk检索67 635条结果,miRDB检索607条结果,对上述数据库检索出的靶基因进行取交集,最终得到284个共同的靶基因。靶基因预测交集见图3。
2.3 miR-494靶基因功能预测
靶基因GO功能富集分析结果显示这些靶基因富集在蛋白质结合、RNA聚合酶Ⅱ核心启动子近端区序列特异性DNA结合、转录因子活性等分子功能中 ......
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