利用TCGA数据集分析LncRNA LINC00319在肺腺癌中的表达及临床意义(1)
利用TCGA数据集分析LncRNA LINC00319在肺腺癌中的表达及临床意义,癌症基因组图谱,长链非编码RNA
[摘要] 目的 研究長链非编码RNA(lncRNA)LINC00319在肺腺癌及其癌旁组织中的表达及临床意义。 方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载516例肺腺癌组织(肿瘤组)与59例癌旁组织(癌旁对照组)RNAseq数据及对应的肺腺癌患者临床数据,对数据中LINC00319基因表达进行分析处理。分析比较其表达与肺腺癌临床病理特征的相关性及对预后的影响。通过COX风险比例模型评估肺腺癌患者预后的独立危险因素。采用基因集富集分析(GSEA)方法预测LINC00319功能富集的分子通路。 结果 LINC00319在肿瘤组中的表达水平显著高于癌旁对照组(P < 0.05),其表达水平与性别、年龄、N分期无关(P > 0.05),与吸烟、T分期、M分期以及Stage分期显著相关(P < 0.05),生存分析显示肺腺癌患者中高LINC00319表达水平预示预后差(P < 0.05) ......
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