高通量测序技术检测非典型子宫内膜增生疾病微小RNA的差异表达(3)
2 结果2.1 small RNA文库表达情况
实验组和对照组经高通量测序分别得到45 446 485和46 115 154条原始序列,数据处理后,得到的序列分别为44 418 630及45 097 769条。
2.2 miRNA及相应靶基因情况
通过软件分析及比对,实验组得到284个已知miRNA及1925个新miRNA;对照组得到409个已知miRNA及2314个新miRNA,进一步通过数据库预测其相应的靶基因。见表1。
2.3 差异miRNA分析
结果显示,在阈值为|log FC| > 2,qvalue < 0.001的条件下,得到3组(346、66、11个)差异miRNA,下游分析共获得18个miRNA,其中17个为上调miRNA,包括:hsa-miR-375、hsa-miR-1307-5p、hsa-miR-671-3p、hsa-miR-1247-5p、hsa-miR-340-3p、hsa-miR-100-3p、hsa-miR-345-5p、hsa-miR-3909、hsa-miR-431-5p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-4454、hsa-miR-182-5p、hsa-miR-4286、hsa-miR-577、hsa-miR-455-3p、hsa-miR-183-5p、hsa-miR-4485;1个为表达下调miRNA ......
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