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编号:13499184
高通量测序在重症肺部感染患者中的应用效果(3)
http://www.100md.com 2020年3月5日 《中国医药导报》 20207
     目前针对高通量测序检测病原体的结果判定还尚无统一标准或共识,Somasekar等[20]自定义mNGS的判读标准,细菌、真菌和寄生虫要求每百万映射读取的Reads(rpm)≥阴性对照的10倍,病毒Reads≥20,同时覆盖度>2%。Zinter等[21]将所有微生物以同一标准划分,要求rpm≥10同时自定义的Z评分≥2分。Simner等[22]在脑脊液病原体测序中沿用了以上的标准,同时认为致病原应排在所有微生物的前5名。Grumaz等[23]设计出SIQ评分试图找到更接近感染的Reads数。国内有部分研究[8,24],判定标准也尚不统一。本研究中仍在一些不足之处,本研究所采用的日本名古屋大学医学院研究的判定方法是否合适仍需要进一步探讨,NGS阳性的病原菌也未进行PCR验证 ......
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