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编号:13809848
生物信息学理念在妇科肿瘤学研究生教育中的实践及影响(2)
http://www.100md.com 2020年9月5日 《中国医药导报》 202025
     1.2 学会使用生物医学数据库和在线分析工具

    生物信息学发展至今,产生许多生物医学数据库和在线分析工具,如基因表达(gene expression omnibus,GEO)数据库、蛋白质相互作用数据库、微小RNA(microRNAs,miRNA)靶标数据库、癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库和用于注释、可视化和集成发现(the database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)的数据库等常用数据库和GEO2R在线工具、GeneMANIA在线工具和医学本体信息检索(Coremine Medical)平台等常用在线分析平台[5]。对于妇科肿瘤学研究生而言,无论是专业型研究生还是学术型研究生,掌握生物信息学知识并不在于如何进行复杂算法的开发、原始数据的处理或数据库的构建,而是如何使用这些数据库和在线工具进行数据挖掘和分析,并用于指导科学研究和临床实践。在妇科肿瘤学研究生教学实践中,我院着重强调“以实践为中心”。比如,Wei等[6]在其研究生课题中巧妙应用了GEO数据库中的3个独立基因芯片数据(GSE25191、GSE28799和GSE33874) ......
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