在上世纪80年代，绿色革命作为菲律宾的国家战略来实施，研究表明，化学药剂的使用对农民种植的水稻产生了负面影响，农民种植单一的高产品种产生的效益要比品种多样化的种植模式小。以农民–科学家合营的股份有限公司为代表的民间组织(NGOs)主要致力于无合成肥料和杀虫剂的条件下的水稻育种。

    从20世纪90年代以来，农业可持续发展的生态作用、经济作用和社会作用，越来越受到民间组织的欢迎。为鼓励这些民间组织，在1997年8月27，总统发表了1071号公告，宣布采用平衡施肥的策略(BFS)，要求针对土壤的特定类型根据合理的有机肥料和无机肥料配比来施肥。BFS示范农场获得水稻的平均产量5.74吨/公顷，比对比农场的水稻产量平均每公顷高1.44吨。

    1994年1月，有机食品专家和倡导者，Mara Pardo de Tavera在马尼拉菲律宾国际会议中心组织了第一场关于有机食品的研讨会。研讨会期间讨论的其中一个问题就是是有机产品缺乏市场或出口途径。为了满足这种需求，1994年9月，Mara Pardo de Tavera的公司联手慈善组织Alay Kapwa Kilusang Pangkalusugan(AKAP)组织有机生产者形成了周末市场 ......