DETs缓冲液对肠道微生物DNA的保存效果
T-RFLP,SrDNA,微生物群落,保存方法
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蔡重阳 张于光 李迪强 任佐华 刘学端 中南大学资源加工与生物工程学院;中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林生态环境重点实验室;湖南农业大学生物安全科技学院;
【摘要】方便高效的保存方法是开展动物肠道微生物研究的重要前提,用T-RFLP(末端限制性片段长度多态性)结合16S rDNA分析评估了野外采样常用的DETs(20%DMSO,0.25 M sodium-EDTA,100 mM Tris,pH 7.5,and NaCl to saturation)缓冲液对不同保存时间(24h,7天,30天,90天)粪便样品肠道微生物DNA的保存效果。结果表明,DETs保存在30天保存时间内微生物群落结构无显著变化,95.6%的T-RFs仍然存在,能效好的保护肠道微生物DNA。
【关键词】 T-RFLP SrDNA 微生物群落 肠道微生物 保存方法
【基金】国家科技部科技基础条件平台建设项目(2005DKA21404) 科技基础性工作专项(2006FY110800-07)
【分类号】R346;Q93
前言微生物广泛存在于自然界中,研究发现,人和动物消化道内附殖着大量微生物,形成复杂而动态平衡的微生物区系[1-2],这些微生物不但与某些疾病相关[3],而且还参与的宿主的能量代谢[4],这也是近年来肠道微生物多样性得到大量研究的重要原因之一,研究人员还在研究各种动物的肠
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摘要：方便高效的保存方法是开展动物肠道微生物研究的重要前提，用T-RFLP(末端限制性片段长度多态性)结合16SrDNA分析评估了野外采样常用的DETs(20%DMSO，0.25M sodium-EDTA，100mM Tris，pH7.5，and NaCl to saturation)缓冲液对不同保存时间(24h，7天，30天，90天)粪便样品肠道微生物DNA的保存效果。结果表明，DETs保存在30天保存时间内微生物群落结构无显著变化，95.6%的T-RFs仍然存在，能效好的保护肠道微生物DNA。
关键词：T-RFLP；16SrDNA；微生物群落；肠道微生物；保存方法
中图分类号：Q939.9 文献标识码：A 文章编号：1673-6273(2009)13-2484-03
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