FZ6基因及其蛋白的生物信息学分析
frizzled基因,Wnt-Fz信号通路
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石鸥燕 李艳云 蔡春泉 张庆江 申长虹 天津医科大学基础医学院;天津儿童医院神经外科;天津医科大学总医院神经外科;
【摘要】目的:对frizzled6(FZ6)基因和Frizzled6(Fz6)蛋白进行生物信息学分析,更多的了解该基因的相关信息,为进一步研究Wnt-Fz信号通路以及FZ基因与神经管发育缺陷相关性研究提供基础。方法:运用Internet上的数据库及程序,对FZ6基因结构、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点、Fz6蛋白的二级结构、蛋白相互作用网络以及Fz蛋白家族的多重序列比对进行生物信息学分析。结果:FZ6基因染色体定位于8q22.3-q23.1,基因全长33995bp,编码706个氨基酸;编码区存在8个SNPs位点,其中错义SNPs4个;多序列比对结果显示10个Fz蛋白家族成员分为4个亚类,Fz3和Fz6为同一类;Fz6蛋白有2个保守的结构域,蛋白序列羧基端缺少其他Fz蛋白普遍存在的S/T-X-V序列模式;其二级结构以α螺旋和随机卷曲为主。结论:通过对FZ6基因及其蛋白的生物信息学分析获得了其相应的生物学特征,为进一步研究奠定基础。
【关键词】 frizzled基因 生物信息学分析 Wnt-Fz信号通路
【基金】天津市卫生局科技基金基金(09KY14) 天津医科大学科学研究基金(2009ky41)
【分类号】Q811.4
前言人的frizzled6(FZ6)基因染色体定位于8q22.3-q23.1,编码Frizzled6(Fz6)蛋白。FZ基因家族共有10个成员:FZ1-FZ10。Fz蛋白是分泌性Wnt蛋白的受体,在细胞极性调节方面发挥关键作用。对于胚胎发育、组织细胞极性、神经突出形成、增殖调控乃至发育阶段和成年时期的许多其它生
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前言
人的frizzled 6(FZ6)基因染色体定位于8q22.3-q23.1，编码Frizzled6(Fz6)蛋白。FZ基因家族共有10个成员：FZ1-FZ10。Fz蛋白是分泌性Writ蛋白的受体，在细胞极性调节方面发挥关键作用。对于胚胎发育、组织细胞极性、神经突出形成、增殖调控乃至发育阶段和成年时期的许多其它生物学过程的正常进行，FZ基因功能都是必需的。有研究表明FZ基因与人类多种疾病相关联，如心肌肥大，家族性渗出性玻璃体视网膜病变以及精神分裂症等。此外，Wang等的研究表明FZ3和FZ6的异常与小鼠内耳毛细胞发育异常以及神经管闭合不全发生存在关联。lshikawa等H)的研究表明FZ5基因的缺失在小鼠胚胎发育早期则更是致命的。为了从基因及蛋白质的序列结构中得到更多的功能信息.我们运用生物信息学手段对FZ6基因和Fz6蛋白进行生物信息学分析，为今后研究其具体功能提供重要线索。
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