癌症研究的生物信息学资源
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毕燕玲 宁秋 黄美群 罗烈伟 广东省医学科学院广东省人民医院检验科;广东药学院生物化学与分子生物学教研室;
【摘要】随着癌症研究的发展,生物信息学成为癌症研究的一个非常重要的方法和手段,本文从微阵列芯片数据管理和分析软件、微阵列数据仓库、蛋白质功能预测工具和蛋白质结构预测工具等四个方面介绍癌症研究的生物信息学资源信息,以给相关研究提供帮助。
【关键词】 生物信息学 癌症 数据库
【基金】广东省医学科研基金资助(A2009316)
【分类号】R73
1引言生物信息学自从1980年成立以来随着基因组序列数据的扩大得到了快速的发展,应用基因芯片技术进行大量的基因表达数据分析使生物信息学方法进一步得到重视,"湿"实验和生物信息学分析应用的结合已经变成生物学和临床研究不可分离的一部分。癌症研究也不例外,应用生物信息
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1 引盲
生物信息学自从1980年成立以来随着基因组序列数据的扩大得到了快速的发展，应用基因芯片技术进行大量的基因表达数据分析使生物信息学方法进一步得到重视，“湿”实验和生物信息学分析应用的结合已经变成生物学和临床研究不可分离的一部分。癌症研究也不例外，应用生物信息学进行癌症研究比较常见的应用是癌症的全基因表达谱分析，通过对比癌症细胞和相同组织正常细胞的基因表达水平，通过对癌组织高表达或低表达基因进行鉴定和聚类，还有一些临床上的问题如癌细胞转移程度或预测临床疗效等，有关基因的生物学功能会引起生物学和临床方面专家的兴趣，因为这些候选基因可以进一步进行生物学研究和发展靶标治疗。
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