沙门氏菌的分子分型方法
脉冲场凝胶电泳,多位点序列分析,多位点可变数串联重复分析
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刘雯静 邱少富 刘雪林 宋宏彬 中国人民解放军疾病预防控制所;
【摘要】沙门氏菌是一类危害人和动物健康的重要致病菌,是引起食物中毒的最常见病原菌之一。本文对目前常用的3种分子分型方法脉冲场凝胶电泳(Pulsed-field gel electrophoresis,PFGE),多位点序列分析(Multi-locus sequence analysis,MLST)及多位点可变数串联重复分析(Multiple-locus variable number tandem repeats analysis,MLVA)在沙门氏菌分子分型的应用做了阐述和比较,为沙门氏菌分型研究提供一定的参考。
【关键词】 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分析 多位点可变数串联重复分析
【基金】科技重大专项资助课题(2008ZX10004-008)和(2009ZX10004-205)
【分类号】R378.22
前言沙门氏菌是一类危害人和动物健康的重要致病菌,其菌属型别繁多,抗原复杂,已经从人和动物中分离出67个菌群、2500多个血清型和变种[1]。全球每年约1600万沙门菌感染病例,其中60万例死亡。世界上最大的一起沙门氏菌食物中毒是1953年发生于瑞典的鼠伤寒沙门氏菌中毒,由吃猪
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1 PFGE
普通的琼脂糖凝胶电泳仅能分离小于500kb的DNA分子,而PFGE可用于大分子DNA的分离,其对极性交替下的DNA片段的分辨力是传统琼脂糖凝胶电泳的20倍,分辨范围可达到10Mb。PFGE技术是将细菌完全包裹在一种特殊的琼脂中,经限制性内切酶消化后,切割成大小不等的片断,然后将其置于脉冲场电泳槽中电泳,完成片段分离的过程。经染色脱色后。在成相仪上显现酶切后的电泳图谱,并经Bionumcrics软件分析,即可判断菌株间的图谱异同,同时根据Cutoff值做出细菌的同源性分析,从而为追踪传染源提供依据。石小路等用PFGE方法,追踪某次沙门氏菌食物中毒的来源,发现从三文治等蛋糕制品中分离的9株菌株与患者分离株PFGE图谱完全
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