郭爱华，陈畅，马蓓颖，唐中华，倪盛兴，何毅，傅启华，金燕樑，江帆，王伟，刘世建

    转化医学是近年来国际医学健康领域日渐崛起的一门新兴学科[1]，倡导以患者为中心，强调基础研究人员与临床医生的密切合作，以提高医疗总体水平。来源于医院患者的生物样本库是开展转化医学研究的重要基础[2]，其中生物样本的临床信息作为临床生物样本库的重要组成部分，更是为转化医学研究提供主要支撑。然而临床生物样本数据量庞大且非结构化，分布较为分散，如何从海量的临床数据中提取出可用信息，并与生物样本本身信息进行关联，形成临床数据与生物样本有效结合的样本库，是从事转化医学研究亟待解决的问题。生物样本库临床信息的有效整合，在提高样本信息使用率的同时也为临床数据分析提供便利。

    1 生物样本库临床信息数据整合的必要性

    目前国内转化医学研究处于起步阶段，尤其是基于临床的研究，需要进一步开展蛋白质组学、基因组学、分子遗传学等转化研究，这都离不开来源于临床的生物样本。转化医学研究人员应与临床医生紧密协作，将临床和基础研究结合，共同开展实验研究。

    然而目前的样本临床信息数据缺乏统一标准，样本信息的采集和管理也缺乏规范化的操作流程。因此迫切需要建立标准的临床样本及临床信息数据的采集、管理规范。通过建立临床药物试验样本库、立项课题样本库、组织样本库等，配备标准储藏设备，规划独立存储区域，制定样本库管理的相关制度和规范化的流程，使用样本库信息化管理软件，为进一步进行科研工作提供强大支撑[3]。

    目前很多生物样本库已有的临床信息大多不完整，仅包含基本信息，如姓名、性别、年龄、临床诊断等，其他临床数据往往分散。研究人员在使用样本时，往往需要重新查阅病历或者电话随访。目前医院临床数据普遍为非结构化或半结构化状态，且医院所采用的信息化系统缺乏兼容性，数据结构不统一，同一患者的数据存储在不同系统中，这种情况下想重新搜集患者临床信息不但费时费力，且往往很难搜集完整 ......