保存温度、时间和冻融次数对RNA样本浓度和纯度的影响
常温,1材料与方法,2方法,3统计学处理,2结果,1不同浓度RNA在4℃放置不同时间对RNA质量的影响,2不同浓度RNA样本常温放置不同时间对RNA浓度和纯度的影响,3组织RNA样本冰上反复冻融对不同浓度R
张汝倩,洪恩宇,于永波,任慧敏,耿迪,杨慧,王雅頔,周萍萍,鲁洁,郭永丽作者单位:100045 北京,国家儿童医学中心(北京)首都医科大学附属北京儿童医院,北京市儿科研究所儿童耳鼻咽喉头颈外科疾病北京市重点实验室(张汝倩、洪恩宇、于永波、任慧敏、耿迪、杨慧、王雅頔、周萍萍、鲁洁、郭永丽);儿童临床数据和样本资源库(洪恩宇、于永波、任慧敏、耿迪、杨慧、王雅頔、周萍萍、鲁洁、郭永丽)
RNA 在人类多种生理和病理过程中发挥着举足轻重的作用。近些年来,随着分子生物技术在生命科学、医学等方面的广泛应用,以 RNA 为靶标进行的组织及细胞的分子生物学研究较为广泛。在 RNA 的科学研究中,高质量 RNA可满足 RT-PCR、Northern blot、基因表达谱、转录组测序和阵列分析等生物学实验的研究需求[1-2],所以能够获得具有生物活性及化学稳定的完整 RNA 分子至关重要。然而由于 RNA 自身结构特性[3]和环境中广泛分布的核糖核酸酶(Ribonuclease,RNase)[4],从血液、组织或培养的细胞中抽提得到的 RNA 的稳定保存相对困难。
目前,有关 RNA 浓度和纯度的影响因素研究主要集中在提取方法、样本类型、储存温度和时间等方面,有文献报道不同的放置时间和温度会影响 RNA 提取的质量浓度,但保存时间对 RNA 的纯度影响各报道结论不统一[5-6]。根据临床检测和科研的需要,提取后 RNA 保存条件和时间对RNA 浓度和纯度的影响也同样非常重要。同时,我们查询文献发现提取后 RNA 的保存温度和放置时间对 RNA 的质量影响也有所不同[7-8],不同浓度的 RNA 反复冻融对其浓度和纯度的影响也鲜有报道。所以,本文通过探讨不同浓度的 RNA 在 4 ℃ 及常温条件下放置不同时间,评估其对RNA 浓度和纯度的影响;另外,通过反复冻融不同浓度的RNA,研究不同浓度的 RNA 冻融次数对其浓度和纯度的影响,以期为临床检测和科学研究提供实验依据。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 主要设备 4 ℃ 和–80 ℃ 冰箱均为三洋产品;300 servies AE 生物安全柜和 NanoDrop 分光光度计均购自美国 Thermo 公司;1 L 便携式液氮罐、高速冷冻离心机均购自德国 Eppendorf 公司;OSE-Y10 电动组织研磨器购自美国 Qiangen 公司。
1.1.2 主要试剂 AllPrep DNA/RNA Mini Kit 购自美国Qiangen 公司;β-巯基乙醇等试剂购自国药集团化学试剂有限公司 ......
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