体内、体外毒性研究面临的最大问题还是评价方法的不确定性和随意性，目前没有能直接反应纳米材料毒性的客观指标存在。从生物学体内的角度来看，最容易做，最容易把握的哺乳动物就是小鼠，但是真的上升到模式动物时，在纳米毒性靶向不确定的情况下，这种假想是不存在的。例如，果蝇是模式动物，但在遗传方面运用较多，胚胎干细胞是理想的筛选胚胎毒性的方法，但也只局限在胚胎毒性，在毒性方面只有经过大批量的筛选才能确定纳米毒性的整体水平，单单做了几种细胞，是不能说明纳米毒性有多小，什么剂量下才能很好的控制纳米毒性。虽然动物试验能持续提供有关纳米毒性的最新信息，但却有一定的局限性，还需考虑经济与伦理方面的问题。目前，已有相关技术手段用于模拟与预测纳米颗粒在活体内的表现，因此希望在将来能够开发可以替代活体试验的检测手段 ......