样品的制备方法根据研究对象、目的和分析测试技术的不同而各异。NMR只需对样品做简单的预处理即可分析。尿液样品采样时一般加入叠氮钠(NaN3)以抑制细菌产生，在测试之前加入磷酸盐缓冲液调节pH值、重水作为锁场信号、三甲基硅烷基钠(TSP)作为内标；血清样品离心后加入重水和TSP可直接测试。LC-MS常用的样品制备方法包括液-液萃取法、固相萃取法、有机试剂沉淀蛋白法等。GC或GC-MS测试前，样品需要进行衍生化，增加其挥发性。

    1.1.2 数据的测定与分析

    代谢组学研究中应用最多的数据采集手段是磁共振成像技术(NMR)和色谱-质谱联用(LC-MS，GC-MS)这两大主流技术。

    首先，需要将测试仪器采集得到的谱图经过软件处理转变成可计算的数据，主要包括溶剂峰消除、相位与基线校正、分段积分、归一化以及标准化等。分段积分是将去除溶剂峰、相位与基线校正好的谱图按照等间隔积分，将峰面积作为变量，每一个积分段对应的值是谱图中该段的积分面积的大小。由于生物样品中内源性组分复杂、含量各异，低含量化合物的变化容易被含量高的化合物所掩盖，使得一些含量虽低但具有重要生物学意义的代谢物不能被识别，这就需要对分段积分得到的数据进行归一化和标准化处理[13] ......