高通量测序研究中药经方对正常小鼠肠道菌群的影响(3)
2.2 药物对正常小鼠肠道菌群多样性的影响 Shannon指数用来评价微生物群落的多样性,利用各样本的测序量在不同测序深度时的微生物多样性指数构建曲线,以此反映各样本在不同测序数量时的微生物多样性。当曲线趋于平坦时,说明测序数据量足够大,可以反映样本中绝大多数的微生物信息,其数值的高低可以表示菌群数量的变化。2时间段各中药组菌群Shannon指数较正常组比较均有变化:在给药第4天,四君组菌群Shannon指数较正常组比较,指数值略有降低,其菌群数量略有减少;麻杏组Shannon指数较正常组升高,其菌群数量增加;麻四组菌群Shannon指数较正常组比较,指数有所减少,其菌群数量有所降低。给药第7天各组指数趋势变化大致相同。综上所述,表明各组药物均可以对正常小鼠肠道菌群的数量及多样性产生影响。见图1。
2.3 药物对正常小鼠肠道菌群相似度的影响 通过韦恩图(Venn diagram)可以比较分析各组之间独有和共有的OTU数目,进而比较多个样本群落间组成的相似度与重叠关系。正常组与四君组:用药第4天与用药第7天 ......
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