基于高通量测序的紫花丹参与白花丹参根际真菌群落结构研究(2)
因此,本研究以同一地块栽培的白花丹参与紫花丹参为研究对象,采用ITS高通量测序技术研究二者的根际真菌群落特征,旨在阐明紫花丹参与白花丹参根际真菌群落的相似性与差异性,为进一步研究丹参根际微生态特征、根际功能菌株的筛选和应用提供依据,为人工调节丹参根际微环境、提升栽培丹参的产量品质、改善栽培地生态环境、解决丹参连作障碍等问题提供技术支持。1 材料与方法
1.1 土壤样品的采集 2018年6月于北京市百鸣堂农场采集根际土壤样品,选择种植过程中未使用任何肥料、农药与除草剂的丹参混合栽培地进行取样。采集时随机选取二年生紫花丹参与白花丹参各5株,将丹参植株与其下土体完整取出,抖落根系外围土壤,取仍附着于根系表面的土壤作为根际土壤。土样过80目筛去除植物根系等杂质,立即存放于-80 ℃冰箱内备用。
1.2 土壤微生物DNA提取 采用CTAB法提取土壤样本总DNA,将提取到的DNA样品溶于100 μL的去离子水中,取5 μL DNA用2.0%的琼脂糖凝胶电泳检测,分析DNA的完整性和相对浓度。
1.3 ITS基因扩增与测序 采用引物ITS1-1F-F(5′-CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA-3′)/ITS1-1F-R(5′-GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3′)扩增真菌ITS1区域 ......
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