基于网络药理学的茵陈五苓散防治肝纤维化机制研究(2)
1.2 肝纤维化疾病靶点收集 通过以主题词“Fibrosis,Liver”检索Comparative Toxicogenomics Database(CTD,http://ctdbase.org/),获取目前已知的肝纤维化靶点列表[9]。1.3 茵陈五苓散与肝纤维化靶点匹配及蛋白互作用网络构建 将茵陈五苓散作用靶点与肝纤维化靶点逐一进行匹配,绘制Venn图,获取茵陈五苓散防治肝纤维化靶点列表。然后,将该列表各靶点输入STRING v11(https://string-db.org/)软件,将Organism参数设置为“homo sapiens”,构建蛋白互作用(Protein-protein Interactions,PPI)网络,并将该网络导入Cytoscape v3.8.0软件进行绘图[10-11]。
1.4 中药-成分-靶点网络构建 逐一匹配中药-成分-靶点关系,并将列表导入Cytoscape软件构建网络,进行绘图,确定网络节点、边、度值等参数。
1.5 GO分析与KEGG通路分析 将靶点列表输入Database for Annotation ......
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