吴思骐 刘建博

    摘要 目的：通過生物信息学技术分析比较慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者与健康人的基因芯片数据，初步筛选COPD的差异表达基因，并借助差异表达基因预测治疗COPD的潜在中药药物。方法：首先通过R分析GSE27597和GSE106986基因数据，得到139个差异表达基因，对差异表达基因进行基因本体(GO)富集分析，并通过String数据库、Cytoscape软件及其插件分析得到14个核心基因，然后对核心基因进行Reactome、KEGG、PANTHER等通路注释，最后通过核心基因与医学本体信息检索平台(Coremine Medical)相互映射，筛选治疗COPD的中药。结果：通过MCODE筛选出14个核心基因包括MMP8、PTX3、DEFA4、CHRM2、FPR2、CX3CR1、FPR1、ORM1、APLNR、PPBP、CHIT1、AGTR2、ARG1，与中性粒细胞脱颗粒、先天免疫系统、趋化因子信号通路等密切相关，其中FPR1和CX3CR1通过影响中性粒细胞向肺部的迁移活动成为COPD病理变化的关键。治疗COPD的潜在中药药物包括黄连、黄芪、黄芩、半夏、丹参、厚朴、姜黄、郁金、瓜蒌等。结论：部分基因会促进香烟烟雾暴露诱发COPD的发生，通过miRNA进行调节可能是中药治疗COPD的潜在作用机制。

    关键词 差异表达基因;慢性阻塞性肺疾病;微小RNA;中药;香烟烟雾

    Abstract Objective：By analyzing and comparing the gene chip data of chronic obstructive pulmonary disease (COPD) patients and healthy people through bioinformatics technology，the differentially expressed genes of COPD are initially screened ......