基于网络药理学探析补中益气汤治疗变应性鼻炎的作用机制
戚媛媛 韩秀丽 王旗旗 杨祺 王玉明摘要 目的:基于网络药理学探析补中益气汤治疗变应性鼻炎的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选得到补中益气汤的化学成分和作用靶点,同时利用GeneCards数据库获得与变应性鼻炎治疗相关的靶基因,利用Cytoscape3.7.1软件将所获得数据进行“药物-成分-疾病-靶点”网络可视化模型构建,使用STRING数据库构建共有靶基因的蛋白质-蛋白质相互作用( PPI)网络,最后采用R软件以P0.4,构建PPI网络,并根据蛋白之间的关联度进行排序。在Venny 2.1在线软件作图工具平台上输入233个药物靶点、1 404个疾病靶点,绘制韦恩图。将补中益气汤中172个潜在活性成分与109个药物-疾病共同靶点输入Cytoscape软件中,删除与靶点无交集的成分,绘制出“药物-成分-靶点-疾病”相互作用的网络图。在STRING数据库中录入上述109个共同靶点,将物种(Organizm)设置为人类(Homosapiens),分析得到PPI网络。
1.6 通路富集分析 在R软件安装Bioconductor软件包“org.Hs.eg.db”并运行,将药物-疾病共同靶点转换成entrezID。然后于R软件安装“ClusterProfiler”包,根据已转换的entrezID,以P<0.05、Q<0.05进行关键靶基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,以探索补中益气汤治疗AR的潜在生物学效益,并将结果以条形图的形式输出。
2 结果
2.1 补中益气汤活性成分及药物靶点 共得到有效活性成分172个,共筛选出233个药物靶点。
2.2 AR相关靶标获得 以“Allergic Rhinitis”为关键词在GeneCards数据库进行检索 ......
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