基于网络药理学与数据挖掘分析中药调节DNA甲基化的用药规律
张艳 周庆兵 徐凤芹摘要 目的:探究調节DNA甲基化的中药活性成分和用药规律。方法:运用GeneCards数据库获取DNA甲基化相关基因靶点,通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)查找靶基因相关的活性成分和中药,纳入条件为类药性≥0.18,口服生物利用度≥30%,构建中药-成分-甲基化靶点作用网络。采用DAVID 6.8数据库分析潜在靶点参与的生物过程及信号通路,同时收集中药功效及性味归经信息,分析调节DNA甲基化的用药规律。结果:获得23个潜在的DNA甲基化靶点,与449个活性成分和342味中药相匹配。其中山柰酚、槲皮素、木犀草素、黄芩素、异鼠李素等可能是干预DNA甲基化的主要活性成分,甘草、半枝莲、丹参、枸杞子、灯盏细辛等可能是干预DNA甲基化的主要中药。相关通路以TNF信号通路、Toll样信号通路等抗炎通路为主。用药规律分析显示,干预DNA甲基化的中药多性寒、味苦,归肝经,具有清热、止痛、补益等功效。结论:本研究系统探讨了中药调节DNA甲基化的活性成分,归纳了中药干预DNA甲基化的用药规律,以期为治疗DNA甲基化相关疾病的实验验证及新药研发提供思路。
关键词 DNA甲基化;表观遗传学;数据挖掘;用药规律;网络药理学;活性成分;中药;信号通路
Medication Rules of Chinese Medicines in Regulating DNA Methylation Based on Network Pharmacology and Data Mining
ZHANG Yan1,2,ZHOU Qingbing1,3,XU Fengqin1,3
(1 Xiyuan Hospital,China Academy of Chinese Medical Sciences,Beijing 100091 ......
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