基于网络药理学的“海藻-昆布”治疗甲状腺肿的作用机制研究
1材料与方法,1海藻,昆布化学成分及靶点的获取,2中药-甲状腺肿相关靶点的搜集与筛选,3蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络构建与核心靶点筛选,4GO-BP生物功能注释及KEGG通路分析,2结果,1海藻-昆
杨甫臣 张世超辽宁中医药大学附属医院沈本医院骨外科,辽宁本溪 110032
甲状腺肿是指由多种原因引起的甲状腺上皮细胞良性增生导致甲状腺弥漫性或结节性肿大,是临床上甲状腺疾病中的常见病。近年来,随着生活压力不断增大,其发病率不断升高,且女性多于男性[1]。中药治疗甲状腺疾病历史悠久且具有很好的效果。《本草备要》[2]中记载:“海藻,泻热、软坚痰、消瘿瘤;昆布,功同海藻而少滑,性雄。治水肿瘿瘤。”海藻归肝、胃、肾经,具有软坚散结、消痰、利水的作用。昆布归肝、胃、肾经,具有同海藻同样的功效。临床上海藻、昆布两味中药常相互配伍加减,用于治疗甲状腺类疾病[3-5]。
网络药理学是一门在多向药理学理论和系统生物学理论基础上分析药物治疗疾病的系统网络,筛选相关的信号节点,推测药物的成分、靶点蛋白、代谢通路等的学科[6]。网络药理学能全面系统地从多角度揭示药物对疾病的作用机制[7]。本研究基于网络药理学研究方法,从成分、靶点、通路等多角度探讨海藻、昆布治疗甲状腺肿的作用机制,为后续研究的开展提供新思路与依据。
1 材料与方法
1.1 海藻、昆布化学成分及靶点的获取
为了获得海藻、昆布两味中药的化学成分,检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP,http://lsp.nwsuaf.edu.cn/tcmsp),并以“口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18 以及半衰期(HL)≥4 h”作为筛选条件,选取同时满足以上条件的作为其主要活性成分。TCMSP 数据库包含了500 味中药,中药成分化合物总计30 069 个,并针对每个化合物提供了OB、DL、药物HL 等性质评价数据[8]。接着,检索PubChem数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/),得到其化学结构以及Smiles 格式。同时通过Swiss Target Prediction 数据库(http://www.swiss-target-prediction.ch/)获得主要活性成分所对应的相关靶点 ......
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