基于网络药理学探讨女贞子治疗肝癌的机制
靶点,癌症,1资料与方法,1女贞子的有效成分收集,2药物作用靶点的预测,3构建化合物和预测靶点网络,4肝癌靶点基因的收集,5药物和疾病的交集靶点,6构建蛋白间相互作用网络,7GO分析及KEGG通路富集分析,2结果,1女贞
张 飞 刘杰民 赵 琦1.贵州中医药大学研究生院,贵州贵阳 550025;2.贵州省人民医院消化内镜科室,贵州贵阳 550002;3.贵州中医药大学第二附属医院消化内科,贵州贵阳 550003
在当今世界范围内,肝癌是最为常见的致命性恶性肿瘤[1]。肝癌的主要病因包括肝炎病毒的感染、黄曲霉素、饮水污染及遗传因素等[2]。根据肝癌的临床表现,中医学认为其属于“积聚”“鼓胀”等疾病,传统的中医药治疗广泛应用于临床肝癌的治疗中[3-4]。
女贞子系木犀科植物女贞(Ligustrum lucidum Ait)的干燥成熟果实。首见于《神农本草经》,具有滋补肝肾、明目乌发等功效。其味苦凉,归经属于肝、肾两经。女贞子作为补益药,经研究发现其化学成分对肝癌的治疗有显著的效果[5]。本研究拟通过网络药理学对女贞子的抗肝癌功效做整体探讨,为今后临床上使用女贞子提供参考依据。
1 资料与方法
1.1 女贞子的有效成分收集
通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中国知网、万方医学网、PubMed 对女贞子的化合物成分进行检索,其检索时限为2011 年1 月至2020 年8 月。通过口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%、类药性(drug likeness,DL)≥0.18或通过SwissTargetPrediction 网站的药代动力学及药物相似性对女贞子的化合物进行初步筛选。
1.2 药物作用靶点的预测
将女贞子收集得到的有效化合物利用TCMSP 中目标信息选项或者SwissTargetPrediction 数据库中的SwissTarget 预测选项对其有效成分进行靶点预测,并通过Uniprot 数据库将所的到的靶点蛋白转化为标准的基因名称。
1.3 构建化合物和预测靶点网络
利用Cytoscape 软件的构图功能,将筛选出来的化合物与预测靶点相结合,构建女贞子的成分与靶点网络图 ......
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