溃疡性结肠炎中巨噬细胞差异基因及功能分析
氧化应激,1资料与方法,1一般资料,2研究方法,2结果,1聚类分析结果,2巨噬细胞识别,3差异基因筛选,4GO功能富集分析,5KEGG信号通路富集分析,3讨论
陈梦雪 王宏刚 谢 睿江苏省淮安市第一人民医院消化内科,江苏淮安 223300
溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)是一种病因不明的肠道炎症性疾病,近年来发病率持续上升[1-2]。随着高通量测序技术发展,单细胞测序(single-cell sequencing,SCS)被用于UC 的发病机制研究。SCS 评价肠道组织的单个细胞异质性,能更准确地解析各类细胞参与的肠道炎症过程[3-4]。
Boland 等[5]对UC 患者的直肠黏膜组织进行SCS分析,发现巨噬细胞与UC 的发生发展密切相关[6]。本研究挖掘SCS 数据[5],筛选UC 与非UC 患者肠道巨噬细胞的差异基因,分析参与的生物学功能和信号通路,从固有免疫细胞角度讨论UC 的发病机制。
1 资料与方法
1.1 一般资料
本研究原始数据来自数据集GSE125527。选取2019 年1 月至12 月前往the VA San Diego 医疗机构就诊的7 例UC 患者和7 名健康对照者的直肠黏膜作为对照SCS 数据进行分析。UC 组纳入标准:处于疾病活动期的UC 患者。对照组纳入标准:行结肠镜筛查的非肠炎人群。排除标准:直肠型UC;合并明显肠道并发症或感染;合并恶性肿瘤;肝肾功能不全[4] ......
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