温州无偿献血人群丙肝病毒感染情况及其基因型的研究(2)
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1.3.2 RT-巢式PCR检测HCV-RNA和基因分型 具体操作参照okamoto法[1]进行。主要步骤为:提取血清总RNA;逆转录合成cDNA,以HCVCore基因区分型PcR引物(引物序列见表1)行套式PCR扩增,两轮PCR 反应体系和反应条件相同。反应体系:10 倍稀释的PCR 缓冲液3 μL,2.5 mmol/L,dNTP 2 μL,dH2O 20.6 μL,上、下游引物各1.5 μL,Taq 酶0.4 μL,模板DNA 1 μL,共计30 μL;反应条件:94℃预变性5 min,94℃变性30 s,55℃退火30 min,72℃延伸30 s,35 个循环,72℃延伸10 min。以聚丙烯酞胺凝胶电泳分析PCR终产物。
表1 HCV-RNA基因分型所用引物
2 结果
2.1 2010~2012年度温州市无偿献血血液检测抗-HCV 不合格率情况
2010~2012年度温州市无偿献血者血液抗-HCV检测不合格率见表2,丙肝病毒的感染情况总体趋稳,各年份变化不大,但相比湖南岳阳市2006~2010年[2]、深圳市宝安区2004~2011年[3]报道的平均不合格率低。
表2 2010~2012年度温州市无偿献血者血液抗-HCV检测不合格率
注:*与2012年比较,**与2010年比较,#与2011年比较
2.2 RT-巢式PCR检测HCV-RNA结果(图1)
PCR产物长度为144 bp对应基因型为1b,PCR产物长度为174 bp对应基因型为2a,PCR产物长度为144 bp和174 bp则对应基因型1b、2a。
图1 HCV基因型分型结果,A为1b阳性(144bp),2a阴性,B为1b阴性,2a阳性(174bp),C为1b阳性(144bp),2a阳性(174bp)
2.3 HCV-RNA基因分型结果
在所检测的68例标本中基因型1b占30 ......
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