赣南地区非综合征性唇腭裂患者血浆代谢组学研究(3)
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2.3 PLS-DA分析
利用SIMCA-P+软件(V11.0,Umetrics AB,Umea,Sweden)对归一化后的数据进行偏最小二乘法(PLS)发现NMR 数据(X变量)和其他变量(Y变量,分组信息)之间的相关联系。偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)使用自适换算(unit variance scaling,UV)的数据标度换算方式。同时用交叉验证后得到的R2X 和Q2(分别代表模型可解释的变量和模型的可预测度)评判模型的有效性。然后,通过排列实验随机多次(n=200)改变分类变量y 的排列顺序得到相应不同的随机Q2值进一步检验模型的有效性。见封三图2。说明以模型的可解释指标R2X 和可预测指标Q2,结合排列试验检验结果共同显示,血清样本的NSCLP组和Control组所建立的模型成立。从得分图可以看出,两组数据虽然没有截然分开,但有各自的类聚关系,可以将两者区分开来,说明NSCLP组样本的代谢组出现显著性差异。
2.4 OPLS-DA分析
正交矫正处理(OPLS-DA)PLS-DA 模型,使用SIMCA-P+软件(V11.0, Umetrics AB, Umea, Sweden)进行正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA),最大化地凸显模型内部不同组别间的差异。OPLS-DA 同时使用自适换算(unit variance scaling,UV)的数据标度换算方式。见封三图3。
2.5组间血浆差异代谢物统计
通过对OPLS-DA 的分析,分析不同组间血浆各代谢物相应的相关系数,进一步归纳有统计学意义的代谢物。在相关系数图中,将每一个变量的loading 值与其标准偏差的平方根值相乘后进行数据的回溯转换 ......
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