RGS20基因在Luminal型乳腺癌的表达及临床病理特征相关性研究(2)

http://www.100md.com 2016年12月25日 《中国现代医生》2016年第36期

     目前，国内外鲜有RGS20基因和乳腺癌的相关性研究，本研究旨在通过检测RGS20基因在各类型乳腺癌组织中的表达，并探讨RGS20与luminal型乳腺癌的临床病理特征的关系。

    1 材料与方法

    1.1 TCGA数据库分析

    癌症基因组图谱(TCGA)数据库是目前最大的癌症生物信息数据库，包含了大量的生物医学信息，我们从中选取乳腺癌患者的RGS20基因表达数据和临床数据，在TCGA数据库中筛选得到1023例乳腺癌病例和98例癌旁对照样本用于分析研究。

    按照2011年《St. Gallen》的乳腺癌分子分型指南，对乳腺癌进行分子分型：Luminal 型(ER和/或 PR+)、Her-2阳性型(Her-2过表达、ER 和 PR-)、三阴性型(ER 和 PR-、Her-2-)。根据上述乳腺癌分子分型标准，在TCGA数据中，筛选出Luminal型乳腺癌共有824例，Her-2阳性型乳腺癌共有38例，三阴性型乳腺癌共有161例。同时，收集入组患者的临床数据：性别、年龄、TNM分期、淋巴结转移等数据，以及收集RGS20的转录组数据(RPKM) ......