梅毒螺旋体Hsp40蛋白的生物信息学分析及基因克隆(2)
1.3 Hsp40生物信息学分析从GenBank中获取梅毒螺旋体(T.pallidum,accession number:NZ_CP003679)的Hsp40基因和蛋白序列。利用Protparam分析Hsp40蛋白的理化特性,采用ProtScale预测其亲水性,采用Swiss-model预测其三级结构。
1.4 Tp Hsp40基因的PCR扩增
依据Tp Hsp40基因序列,设计PCR引物。Hsp40-F:5’-AGCCATATGGTGGCAAAGAAGGATTATTA-3’;和Hsp40-R:5’-CCCAAGCTTCTACTTGAGACTTG-AAA-3’。然后由赛默飞世尔科技公司(广州)进行合成。以提取的梅毒螺旋体DNA为模板进行PCR扩增Hsp40基因片段。PCR体系:5 μL 10×PCR 缓冲液,1 μL引物 Hsp40-F(10 μM),1 μL引物Hsp40-R (10 μM),0.1 μg模板Tp DNA,1 μL DNA聚合酶(2.5 U/μL),1 μL dNTP Mixture(10 mM) ......
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