基于蛋白质组学的乳腺癌标志物筛选及其应用
癌症,1资料与方法,1临床资料,2方法,3统计学方法,2结果,1乳腺癌表达差异标志物的筛选,2GEPIA数据库验证上述差异的蛋白在侵袭性乳腺导管癌患者中的mRNA表达水平,3筛选出的差异蛋白与侵袭性乳腺癌患者生存期的相
邓克瑜 赵莉 高琳 黄静怡 赵盼 吴伟晴1.深圳市人民医院健康管理中心 暨南大学第二临床医学院 南方科技大学第一附属医院,广东深圳 518020;2.深圳市人民医院临床医学研究中心 暨南大学第二临床医学院 南方科技大学第一附属医院,广东深圳 518020
乳腺癌(breast cancer,BCA)是目前造成全球女性死亡的第二大癌症,自1990 年以来,在中国一些城市地区乳腺癌的发病率的增长速度约是全球发病率的2倍。至2008 年,中国有169 452 例浸润性乳腺癌病例和44 908 例相关死亡病例,占全球病例的12.2%和相关死亡病例的9.6%。肿瘤异质性是恶性肿瘤的重要特征之一,表现为同一肿瘤内存在不同基因型或表型的肿瘤细胞对药物的敏感度不同,是肿瘤治疗的巨大挑战。基因组的不稳定是造成肿瘤异质性的主要原因之一。目前乳腺癌治疗的主要挑战是由于肿瘤细胞具有异质性在治疗策略的选择上存在一定的问题。生物标志物是指可以标记系统、器官、组织、细胞及亚细胞结构或功能的改变或可能发生的改变的生化指标,多用于疾病诊断、判断疾病分期或评价新药或新疗法。尽管基因组学已经用于生物标记物的发现很长一段时间,但是所发现基因功能的解释需要在功能网络的背景下借助蛋白质组学的力量进行。蛋白质组学生物标志物可以提供蛋白质动态特性的关键信息,包括功能、转译后修饰、与其他生物分子的相互作用以及对环境因素的反应。有文献报道,与基因组数据比较,蛋白水平与基因组中基因的拷贝数变化之间具有低相关性,意味着许多基因组变异没有或只有部分参与到功能蛋白质的翻译。
因此,本研究通过以质谱(mass spectrometry,MS)技术和蛋白质组学工作流及qRT–PCR 技术筛选与乳腺癌发生发展及预后的标志物,有助于针对不同亚型患者,建立更有效的乳腺癌诊断手段、预测病因及干预治疗。
1 资料与方法
1.1 临床资料
1.1.1 组织标本 选取4 组(含癌组织和癌旁组织)乳腺癌患者的组织标本,所有患者均为侵袭性导管乳腺癌患者 ......
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